هر آمینو اسید در ساختار خود 4 بخش دارد که به کربن متصل است.
کربن یک اتم 4 ظرفیتی هست پس 4 گروه می تواند به آن متصل شود.
این 4 گروه شامل موارد زیر هست:
گروه آمین: NH2 همان گروه آمین هست که شامل نیتروژن و هیدروژن می باشد. در همه آمینو اسید ها این گروه وجود دارد.
گروه کربوکسیل:COOH همان گروه کربوکسیل هست و مانند گروه آمین این گروه هم در همه آمینو اسید ها وجود دارد.
هیدروژن: H به تنهایی به کربن متصل است و هیدروژن نیز در همه آمینو اسید ها وجود دارد.
گروه R : تفاوت بین آمینو اسید ها به خاطر این گروه هست. گروه R ویژگی های منحصر به فردی به آمینو اسید ها می دهد و باعث تفاوت ماهیت آمینو اسید ها از هم می شود.
این آمینو اسید ها به وسیله پیوند پپتیدی به هم متصل می شوند و در نهایت یک رشته پلی پپتیدی تشکیل می شود.
در هر پیوند پپتیدی یک مولکول آب آزاد می شود زیرا این پیوند از نوع سنتز آبدهی هست.